Le conseil d’administration est composé de 12 membres :
- 6 membres désignés par le Préfet (DIRECCTE, DDTM, DRAAF, DDPP, Chambre de Commerce et d’Industrie, Chambre Régionale d’Agriculture).
- 6 membres désignés par le conseil de Bordeaux Métropole.
Le Président du conseil d’administration est élu par ses membres.
6 membres, à simple pouvoir consultatif, représentant des entreprises concessionnaires et des clients du Marché d’Intérêt National.